Аппарат управления 

• Руководство
• Отдел финансового контроля - бухгалтерского учета
• Отдел кадров
• Отдел продаж и маркетинга
• Отдел экологии, учета и использования имущества и земли

• Кокинский опорный пункт

Лаборатория цветочно-декоративных культур

Отдел агротехнологий в садоводстве

Отдел агрохимии и почвоведения

Лаборатория защиты растений

Отдел репродуктивной биотехнологии

• Лаборатория молекулярно-генетических и вирусологических исследований
• Лаборатория тиражирования растений садовых культур
• Сектор культуры тканей садовых культур  

Лаборатория аналитической биохимии и физиологии сельскохозяйственных растений

Отдел управления знаниями и научной информации

•  Сектор редакционно-издательской и патентной работы 

Отделение генофонда и биоресурсов растений

• Научно-исследовательский отдел генофонда и биоресурсов

           Лаборатория полевых культур
           Лаборатория овощных культур и картофеля
 

 Селекционно-семеноводческий центр

•  Научно-экспериментальный отдел
• Отдел питомниководства  и трансферта технологий 

Научно-экспериментальный участок Измайлово

Административно-хозяйственный отдел

Служба главного инженера

• Группа обслуживания зданий и коммуникаций
• Машинно-тракторный парк Измайлово
• Машинно-тракторный парк Михнево

 Оренбургский филиал